这种情况有两种，一种是个体工商户，多数地区对于个体户是没有特别要求的，你可以直接注销营业执照，但可能会有个别地区需要税务注销证明，这就只能缴纳罚款办理税务登记证然后注销了。
如果是公司，则需要的手续很繁琐，需要清算，而这个清算是需要首先注销税务登记证的。
机构是机构，公司是公司，不是一回事，机构没有财产权，比如一般公司指有限公司，意思就是以你投入的注册资本承担有限责任，公司倒了，只是你投的钱没了，你的房子不受影响的（你没抵押的话），而机构在意义上一般是无限责任，就是父债子偿，所以现在机构也能注册，但国家大部分要求注册有限公司，有限公司名称有具体要求，严格的话不能加机构，不过实际注册过程还是靠经办人员对政策的理解，建议你找注册代理，他们人熟，容易通过，现在不合理名字也很多（满意啊）
经营烟草的话，是必须有烟草证的；
不过烟草是不允许公司经营售卖的。
公司的话，流程都一样的。如下所示：
先去当地工商局提交名称登记和审查申请，名称预核通过后，办理营业执照。
在提交名称登记时准备好注册资本，先在银行开个临时户，存入。找会计事务所出具验资报告。
拿营业执照副本去技术监督局办理组织机构代码证。
一个月内去税务局办理税务登记证，在登记证的同时，可以一起申请一般纳税人资格，不过各地办理的程序有所不同，需要咨询所在税务局的税管员。营业执照原件，法人身份证原件，委托授权书，预审通知书，当年度的审计报告，以上是企业年检必要的文件，都要加盖公章。营业执照到工商部门办理，因地域不同，具体带什么资料到当地工商部门咨询;卫生证到当地食品药品监督管理局办理，具体流程还是要咨询当地食药局。身份证复印件两份(正反面复印)，
2、先去政务中心的工商窗口申请字号名称或是工商所直接申办，取得名称预先核准通知书; 3、场地证明(房租合同一份、房产证复印件一份或是村委会证明一份);
4、照片3张; 5、个体工商户注册申请表一份(工商所提供);
如经营农药、食品、危险化学品、餐饮、特种养殖、卷烟等前置项目，就要先注册名称后办理这些前置许可证，再凭前置许可证复印件(需要查验原件)才能办理营业执照;规模较大的经营场所，如商场、酒店还应提交消防意见书;县(区)外人员还应提交流动人口计生证。
可以凭营业执照去质量技术监督管理局申办组织机构代码证。